Rozlúčkou na letisku v Larnake za účasti cyperského prezidenta Nicosa Anastasiadesa uzavrel pápež František v sobotu ráno 4. decembra prvú etapu svojej apoštolskej cesty a lietadlom spoločnosti Aegean sa vydal smerom do Grécka, kde strávil ďalších 48 hodín.

Stretnutie pápeža Františka s biskupmi, kňazmi, rehoľníkmi a rehoľníčkami, so seminaristami a katechétmi v aténskej katedrále bolo posledným verejným stretnutím v úvodný deň jeho pobytu v Grécku - v sobotu 4. decembra. Neskôr večer ešte Svätého Otca čakalo súkromné stretnutie s členmi Spoločnosti Ježišovej na apoštolskej nunciatúre. 

Vo štvrtok 2. decembra zomrel v Leuvene po dlhom pobyte v nemocnici arcibiskup Aldo Giordano, apoštolský nuncius pri Európskej únii. Rodák z Diecézy Cuneo predtým sedem rokov pôsobil ako nuncius vo Venezuele.

Prvú svätú omšu na Cypre slávil pápež František 3. decembra s približne 10 000 veriacimi na športovom štadióne hlavného mesta. V homílii veriacich vyzval zanechať individualizmus a obnoviť bratstvo, spoločne znášať rany.

Druhý deň apoštolskej cesty na Cypre smerovali kroky pápeža Františka k pravoslávnemu arcibiskupovi Cypru Chryzostomovi II. na Pravoslávne arcibiskupstvo Cypru v Nikózii. Odtiaľ sa presunul do pravoslávnej katedrály na stretnutie so Svätou synodou.